Trường Đại học Y Dược Hải Phòng hiện có khoảng 7000 sinh viên đại học, thuộc các ngành sau:

- Bác sĩ Đa khoa hệ chính quy với thời gian học 6 năm, mỗi năm đào tạo 500 sinh viên. Bác sỹ đa khoa hệ liên thông (4 năm) từ y sỹ đa khoa, mỗi năm khoảng 100 sinh viên. Trường là 1 trong 5 Đại học Y Dược của cả nước đang tham gia thực hiện Chương trình đổi mới đào tạo Bác sỹ Y khoa dựa theo năng lực, do Bộ Y tế chủ trì, Ngân hàng thế giới tài trợ và Đại học Y Havard (Hoa Kỳ) hỗ trợ kỹ thuật, từ 2016.

- Bác sĩ Y học dự phòng (thời gian đào tạo 6 năm, mỗi năm 60-70 sinh viên);

- Cử nhân Điều dưỡng chính quy (4 năm, 100 sinh viên/năm) và hệ vừa làm vừa học (4 năm, mỗi năm 100-200 sinh viên);

- Bác sĩ Răng Hàm Mặt (thời gian đào tạo 6 năm, mỗi năm đào tạo 60-70 sinh viên);

- Cử nhân Kỹ thuật y học (thời gian đào tạo 4 năm, mỗi năm 60-70 sinh viên);

- Dược sĩ hệ chính qui (5 năm, mỗi năm 100 sinh viên) và hệ liên thông (4 năm, mỗi năm khoảng 20 sinh viên từ dược sỹ trung học)

- Bác sĩ Y học cổ truyền (6 năm, mỗi năm 60 sinh viên).

Cùng với quá trình đổi mới của ngành Giáo dục, Trường đang tập trung đổi mới phương pháp giảng dạy tích cực, lấy người học làm trung tâm của quá trình đào tạo, và thực hiện đào tạo theo tín chỉ, cải tiến chương trình đào tạo hướng tới năng lực đầu ra của người học. Thông qua các phương pháp giảng dạy đa dạng, bao gồm cả thuyết trình theo truyền thống, sử dụng trình chiếu powerpoint, cập nhật nguồn tài nguyên trên mạng internet, thực tập tại các phòng thí nghiệm, giảng dạy bên giường bệnh, giảng dạy dựa trên vấn đề, y học dựa trên chứng cứ, thực hành và nghiên cứu tại các bệnh viện và trung tâm y tế... sinh viên đã thu được các kiến thức và kỹ năng cần thiết cho nghề nghiệp của mình.